Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP6Q16828 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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