Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NTRK2Q16620 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NTRK2Q16620 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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