Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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