Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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NR1D2Q14995 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR1D2Q14995 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NR1D2Q14995 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR1D2Q14995 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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NR1D2Q14995 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NR1D2Q14995 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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NR1D2Q14995 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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NR1D2Q14995 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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NR1D2Q14995 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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NR1D2Q14995 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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NR1D2Q14995 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NR1D2Q14995 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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NR1D2Q14995 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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