Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNB1Q14721 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms