Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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