Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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