Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CNTN1Q12860 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CNTN1Q12860 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CNTN1Q12860 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CNTN1Q12860 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CNTN1Q12860 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CNTN1Q12860 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CNTN1Q12860 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CNTN1Q12860 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CNTN1Q12860 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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