Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms