Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FAM27E3Q08E93 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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