Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms