Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSRP1Q08945 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms