Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms