Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms