Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP7AQ04656 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms