Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms