Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms