Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRPC1P48995 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRPC1P48995 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRPC1P48995 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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