Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms