Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AP000842.4-201ENST00000638781 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 LINC00879-205ENST00000470465 757 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AL583859.2-201ENST00000634462 1127 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 WDYHV1-201ENST00000287387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms