Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HHLA1C9JL84 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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