Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms