Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms