Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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ARL2-SNX15V9GYD0 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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ARL2-SNX15V9GYD0 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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