Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD54BQ9Y620 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms