Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 313.2 ms