Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms