Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms