Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms