Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGAP28Q9P2N2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms