Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms