Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms