Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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GIN1Q9NXP7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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GIN1Q9NXP7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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GIN1Q9NXP7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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