Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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