Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms