Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2Q9BX26 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2Q9BX26 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms