Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms