Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms