Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms