Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EDAQ92838 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EDAQ92838 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms