Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLDN19Q8N6F1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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CLDN19Q8N6F1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CLDN19Q8N6F1 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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