Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00523Q86TU6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms