Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPOCD1Q6ZMY3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPOCD1Q6ZMY3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPOCD1Q6ZMY3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPOCD1Q6ZMY3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPOCD1Q6ZMY3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPOCD1Q6ZMY3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCD1Q6ZMY3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCD1Q6ZMY3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCD1Q6ZMY3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms