Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EEF1DP3Q658K8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1DP3Q658K8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms