Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD1Q5SYB0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms