Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms