Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms