Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 CLEC4M-210ENST00000597522 811 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 AP006545.2-201ENST00000607091 461 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 AL031587.4-201ENST00000609265 691 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 Metazoa_SRP.163-201ENST00000611926 277 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 ADGRG5-207ENST00000615867 762 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 Metazoa_SRP.97-201ENST00000618280 304 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 CSTL1-205ENST00000619238 477 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 AC092471.2-201ENST00000637219 651 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 GNG14-202ENST00000640151 425 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 CHI3L2-202ENST00000369748 1468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 UPF3B-204ENST00000619445 1385 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 NIFK-AS1-202ENST00000414554 1411 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 CCNB3P1-201ENST00000504855 1431 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 EIF2B3-203ENST00000372183 1457 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 DHRS1-202ENST00000396813 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 YAE1D1-201ENST00000223273 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF816-201ENST00000270457 582 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 CDKN2AIPNLP2-201ENST00000274516 352 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 FAM96A-201ENST00000300030 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 TBC1D21-201ENST00000300504 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 AL391987.4-201ENST00000377547 439 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP20-1Q3LI63 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms