Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
USF2Q15853 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
USF2Q15853 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
USF2Q15853 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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