Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IHHQ14623 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IHHQ14623 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IHHQ14623 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IHHQ14623 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IHHQ14623 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IHHQ14623 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IHHQ14623 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IHHQ14623 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IHHQ14623 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IHHQ14623 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IHHQ14623 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IHHQ14623 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IHHQ14623 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IHHQ14623 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IHHQ14623 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IHHQ14623 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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